首先要注意鱼类冷库的开关门问题，定期检查冷库门的密合，封条是否老化脱落，冷库门是否因年岁久远等问题老化歪斜等，同时尽量减少冷库门的开关。
其次，鱼类冷库在炎热的夏季，要保证冷库机组冷凝器的散热。因为制冷机组上的冷凝器散热片很容易被灰尘等弄脏，应根根据实际情况，定期清理，以保持制冷机组良好的传热效果。
另外，还有一点需要注意的是，因为鱼类海鲜等水产有着一些特有的气味，如果在库内处理不当，很容易造成冷库内的气味非常难闻。因此，水产在进入冷库储存以前，应当充分做好预冷工作，即在预冷间内就将水产的特殊气味彻底处理掉，即用低温降低水产的活性，这样进入鱼类冷库内的水产就不会带有异味，会更好地达到储存的效果。